Obiectivul Flappy Dunk este de a menține o minge de baschet în aer prin clic, evitând contactul cu tavanul sau podeaua, precum și asigurarea trecerii mingii prin numeroasele cercuri. Scopul este de a înscrie puncte prin trecerea cu succes a mingea prin cercuri, cu un șut ratat rezultând la sfârșitul jocului.